Der 1,96 m große, deutschstämmige Torhüter begann seine Karriere bei Dynamo Dresden (1994/95), gehörte dann zum Aufgebot des 1. FC Kaiserslautern (1995/96), bevor er in der englischen Premier League für Bradford City A.F.C. spielte. Seit 1997 steht er beim Middlesbrough F.C. zwischen den Pfosten. Mit diesem Club gewann er 2004 den englischen Ligapokal.

Schwarzer spielte bisher mehr als 20 Mal in der australischen Nationalelf, unter anderem beim Konföderationen-Pokal 2005. Im November 2005 war er der Held der Socceroos, als er im entscheidenden Elfmeterschießen beim WM-Qualifikationsspiel zwei Strafstöße der Uruguayer parierte.

Mark Schwarzers Eltern wanderten in Schwarzers Geburtsjahr 1972 nach Australien aus. Seine Familie stammt aus Freiberg, einer Kleinstadt im Schwäbischen in der Nähe von Stuttgart. Mark Schwarzer spricht fließend deutsch und genießt sowohl bei den Fans des FC Middlesbrough als auch bei den Socceroos Kultstatus.